Chaque chapitre d'un thème propose la même démarche : observation, émission d'hypothèses, recherche (expérimentation, manipulation et/ou documentation), formulation plus ou moins aidée d'une synthèse (textes à trous, étiquettes, mots clés).   Tous les chapitres s'ouvrent sur les connaissances préalables des élèves (scolaires ou issues de la vie quotidienne)  et se terminent par un bilan. Et aussi les Enquêtes de la luciole Cycle 3 :  5 documentaires scientifiques (5x13 min) dans chaque DVD.